富營養(yǎng)化水體底層堆積的有機物質在厭氧條件下分解產生的有害氣體，以及一些浮游生物產生的生物毒素(如石房蛤毒素)也會傷害水生動物。

　　富營養(yǎng)化水中含有亞硝酸鹽和硝酸鹽，人畜長期飲用這些物質含量超過一定標準的水，會中毒致病等等。

　　水體富營養(yǎng)化，常導致水生生態(tài)系統(tǒng)紊亂，水生生物種類減少，多樣性受到破壞。