氫鍵通常可用X-H…Y來表示。其中X以共價鍵（或離子鍵）與氫相連，具有較高的電負性，可以穩(wěn)定負電荷，因此氫易解離，具有酸性（質(zhì)子給予體）。而Y則具有較高的電子密度，一般是含有孤對電子的原子，容易吸引氫質(zhì)子，從而與X和H原子形成三中心四電子鍵。